Syno®人类全基因组CRISPR文库(Human Genome CRISPR Libraries)

CRISPR技术作为继ZFN和TALEN之后第三代基因编辑技术,具有高效、快速、精准等特点,广泛应用于基因功能研究、药物开发、作物育种、分子诊断、精准医疗等领域。利用CRISPR 文库进行基因组功能筛选一直是当下热门的研究手段,被全球知名期刊争相报道。

CRISPR文库虽然是进行科学研究的强大工具,但是由于其后期筛选工作量大、成本消耗高,也成为了其普遍应用的阻碍。九游会J9科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究工作,不断提升服务和产品的供应能力,在定制化CRISPR文库构建的基础上,推出Syno®人类全基因组CRISPR文库,领先的设计和规范化的文库构建实现高质量交付,降低客户的研究成本,缩短产品交付周期。

文库产品优势

  1. 精准的sgRNA设计:利用有效的sgRNA设计模型结合深度学习算法,设计出具有高靶向活性和低脱靶率的sgRNA序列。
  2. 优化的载体:具备Puro药筛功能,可进行慢病毒包装,提高转染效率。
  3. 节约成本:高编辑效率CRISPR文库,减轻后期筛选工作的难度,降低研究成本。
  4. 一站式服务:提供NGS验证、病毒包装、生信分析等定制化的服务。
  5. 严格质控:构建的文库覆盖率>99.9%,均一性<10。
  6. 交付周期短:质粒文库次日发货。
    CRISPR-one-stop-service

文库产品详情

Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库

Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库根据Genome CRISPR数据库中记录的以前发表的CRISPR筛选中的表型以高靶向活性和低脱靶效率为准则,结合多种不同的设计原则,选择评分较高的sgRNA序列。根据近期发表的评分规则,Syno®CRISPR文库的评分要优于GeCKOv2文库和随机挑选的已发表sgRNA样本。

Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库由三个独立子库A、B、C组成,A和B文库分别针对18,913和18,334个蛋白质编码基因。子库A包含根据设计标准排名最好的sgRNA,在较低的文库覆盖率下实现高质量的筛选。子库B包含第二层sgRNA,当需要更高的sgRNA覆盖率时,可以用来补充子库A。子库C是通过整合大规模CRISPR筛选的标准化资源,以及多个效率指标,对广泛采用的CRISPR文库中的300,000多个特有的sgRNA进行评估和排序,设计出了一个优化的人类最小全基因组敲除文库,针对18,761个基因,每个基因设计2个优化的sgRNA,合计有37,522个基因靶向和200个非靶向sgRNA。子库C的大小比目前公开的人类全基因组CRISPR文库均小。虽然子库C较小但是并不影响对必须基因的识别,多用于复杂条件下癌症细胞模型的CRISPR筛选。

产品编号 产品名称 序列信息 载体信息 价格(元) 规格
STCRI211101 Syno®人类全基因组
CRISPR敲除文库
(Human Genome CRISPR Knockout Libraries)
子库A:
靶向18,913个基因,设计74,552个sgRNA序列和435个对照(非靶向)sgRNA序列,合计74,987个sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)pLentiGuide-Puro
(双质粒系统)pLentiGuide-Puro-GFP
(双质粒系统)
咨询 200μg
STCRI211102 子库B:
靶向18,334个基因,设计71,048个sgRNA序列和435个对照(非靶向)sgRNA序列,合计71,483个sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)pLentiGuide-Puro
(双质粒系统)pLentiGuide-Puro-GFP
(双质粒系统)
咨询 200μg
STCRI211103 子库C:
靶向18,761个基因,设计37,522个sgRNA序列和200个对照(非靶向)sgRNA序列,合计37,722个sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)pLentiGuide-Puro
(双质粒系统)pLentiGuide-Puro-GFP
(双质粒系统)
咨询 200μg

*更多服务信息,请咨询support@synbio-tech.com

Syno®人类全基因组敲除阴性对照库

Syno®人类全基因组敲除阴性对照库可作为人全基因组CRISPR sgRNA文库的阴性对照,适用于人类细胞下的实验。

产品编号 产品名称 序列信息 载体信息 价格(元) 规格
STCRI24301 Syno®人类全基因组
敲除阴性对照库
(Human Genome Knockout Negative Control Library)
20个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24302 50个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24303 100个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24304 200个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24305 500个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24306 1000个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg
STCRI24307 2000个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。 pLentiCRISPR v2-Puro
(单质粒系统)
咨询 150μg

Syno®人类全基因组CRISPR激活文库

产品编号 产品名称 序列信息 载体信息 价格(元) 规格
STCRI233301 Syno®人类全基因组
CRISPR激活文库
(Human Genome CRISPR Activation Library)
子库A:
靶向18,885个基因,设计56,266个sgRNA序列和496个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
(双质粒系统)
咨询 200μg
STCRI233302 子库B:
靶向18,843个基因,设计55,980个sgRNA序列和496个对照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
(双质粒系统)
咨询 200μg

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Syno®人类膜蛋白CRISPR激活文库

产品编号 产品名称 序列信息 载体信息 价格(元) 规格
STCRI113345 Syno®人类膜蛋白
CRISPR激活文库
(Human Membrane Protein CRISPR Activation Library)
靶向6,213个基因的启动子,设计58,071个sgRNA序列和500个对照(非靶向)sgRNA序列,合计58,571个sgRNA序列。 pKVL2-U6gRNA_
SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W
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Human Pathway sgRNA文库

CRISPR文库是基于CRISPR/Cas9技术建立的高通量基因筛选方案,研究基因在代谢通路或某些特定疾病发生过程中的功能,确认与表型相关的基因或筛选药物新靶点。

九游会J9科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究与开发,在CRISPR定制化文库构建服务的基础上,为持续提升产品和服务供应能力,从基因、细胞、免疫系统等不同研究层面推出100多种Human pathway sgRNA文库,为特定通路的靶向筛选等相关研究提供高效工具。

产品优势

  1. 100+ Human pathway sgRNA文库供客户选择
  2. 文库的靶点基因是通过KEGG与较新的NCBI RefSeq人基因组数据交叉、并与科学研究前沿相结合下的选择
  3. 九游会J9科技SynoGPS平台下的独家算法设计,每个靶点包含4条低脱靶效率的sgRNA序列
  4. 200+定制化文库交付经验,保证产品质量
  5. 相关客户陆续发表文献26篇,最高影响因子达36.558

人源Pathway sgRNA文库信息表如下:

代谢过程 文库编号 通路名称 载体 基因数目
常见通路(现货) SHPF231311 ABC transporter pathway Lentisyn001 100
SHPF231312 Acute myeloid leukemia pathway 45
SHPF231313 Adipogenesis pathway 126
SHPF231314 Adult stem cell pathway 58
SHPF231315 Angiogenesis pathway 92
SHPF231316 Apoptosis pathway 68
SHPF231317 cAMP&Ca pathway 91
SHPF231318 Cell cycle pathway 84
SHPF231319 Chemokine pathway 134
SHPF231320 Drug Resistance pathway 348
SHPF231321 ES differentiation pathway 334
SHPF231322 GPCR pathway 280
SHPF231323 Hormone activity pathway 108
SHPF231324 Ion channel pathway 67
SHPF231325 P450 pathway 57
SHPF231326 Tumor metastasis pathway 60
SHPF231327 Tumor suppressor pathway 720
SHPF231328 Neelamegham human glycogene pathway 347
SHPF231329 Human mTORC1 pathway 713
SHPF231330 Pan druggable library 75
DNA复制与修复 SHPF231001 Base excision repair 33
SHPF231002 DNA replication 36
SHPF231003 Fanconi anemia pathway 54
SHPF231004 Homologous recombination 41
SHPF231005 Mismatch repair 23
SHPF231006 Non-homologous end-joining 13
SHPF231007 Nucleotide excision repair 47
转录 SHPF232001 Basal transcription factors 45
SHPF232002 RNA polymerase 34
SHPF232003 Spliceosome 154
翻译 SHPF233001 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 66
SHPF233002 mRNA surveillance pathway 97
SHPF233003 Nucleocytoplasmic pathway 108
SHPF233004 Ribosome biogenesis in eukaryotes 118
SHPF233005 Ribosome 167
运输与分解代谢 SHPF234001 Autophagy 141
SHPF234002 Endocytosis 251
SHPF234003 Lysosome 132
SHPF234004 Mitophagy 72
SHPF234005 Peroxisome 82
SHPF234006 Phagosome 152
细胞群落 SHPF235001 Adherens junction 71
SHPF235002 Focal adhesion 201
SHPF235003 Gap junction 88
SHPF235004 Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells 143
SHPF235005 Tight junction 169
细胞死亡 SHPF236001 Apoptosis 136
SHPF236002 Cell cycle 127
SHPF236003 Cellular senescence 156
SHPF236004 Ferroptosis 41
SHPF236005 Necroptosis 159
SHPF236006 Oocyte meiosis 131
SHPF236007 p53 signaling pathway 73
细胞运动 SHPF236101 Regulation of actin cytoskeleton 229
折叠,分选及降解 SHPF237001 Proteasome 46
SHPF237002 Protein export 23
SHPF237003 Protein processing in endoplasmic reticulum 171
SHPF237004 RNA degradation 79
SHPF237005 SNARE interactions in vesicular transport 33
SHPF237006 Sulfur relay system 8
SHPF237007 Ubiquitin mediated proteolysis 142
生长与再生 SHPF238001 Axon guidance 182
SHPF238002 Osteoclast differentiation 128
信号转导 SHPF239001 AMPK signaling pathway 121
SHPF239002 Apelin signaling pathway 139
SHPF239003 Calcium signaling pathway 240
SHPF239004 cAMP signaling pathway 225
SHPF239005 cGMP-PKG signaling pathway 167
SHPF239006 ErbB signaling pathway 85
SHPF239007 FoxO signaling pathway 131
SHPF239008 Hedgehog signaling pathway 56
SHPF239009 HIF-1 signaling pathway 109
SHPF239010 Hippo signaling pathway 157
SHPF239011 JAK-STAT signaling pathway 166
SHPF239012 MAPK signaling pathway 294
SHPF239013 mTOR signaling pathway 156
SHPF239014 NF-kappa B signaling pathway 104
SHPF239015 Notch signaling pathway 59
SHPF239016 Phosphatidylinositol signaling system 97
SHPF239017 Phospholipase D signaling pathway 148
SHPF239018 PI3K-Akt signaling pathway 354
SHPF239019 Rap1 signaling pathway 210
SHPF239020 Ras signaling pathway 236
SHPF239021 Sphingolipid signaling pathway 119
SHPF239022 TGF-beta signaling pathway 95
SHPF239023 TNF signaling pathway 114
SHPF239024 VEGF signaling pathway 59
SHPF239025 Wnt signaling pathway 170
信号分子与互作 SHPF231011 Cell adhesion molecules 157
SHPF231012 Cytokine-cytokine receptor interaction 295
SHPF231013 ECM-receptor interaction 88
SHPF231014 Neuroactive ligand-receptor interaction 367
SHPF231015 Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor 100
循环系统 SHPF231111 Adrenergic signaling in cardiomyocytes 154
SHPF231112 Cardiac muscle contraction 87
SHPF231113 Vascular smooth muscle contraction 134
免疫系统 SHPF231211 Antigen processing and presentation 78
SHPF231212 B cell receptor signaling pathway 82
SHPF231213 Chenokine signaling pathway 192
SHPF231214 Complement and coagulation cascades 86
SHPF231215 C-type lectin receptor signaling pathway 104
SHPF231216 Cytosolic DNA-sensing pathway 66
SHPF231217 Fc epsilon RI signaling pathway 68
SHPF231218 Fc ganna R-mediated phagocytosis 97
SHPF231219 Hematopoietic cell lineage 99
SHPF231220 IL-17 signaling pathway 94
SHPF231221 Intestinal immune network for IgA production 49
SHPF231222 Leukocyte transendothelial migration 114
SHPF231223 Natural killer cell mediated cytotoxicity 132
SHPF231224 Neutrophil extracellular trap formation 190
SHPF231225 NOD-like receptor signaling pathway 186
SHPF231226 Platelet activation 124
SHPF231227 RIG-I-like receptor signaling pathway 71
SHPF231228 T cell receptor signaling pathway 104
SHPF231229 Th1 and Th2 cell differntiation 92
SHPF231230 Th17 cell differentiation 108
SHPF231231 Toll-like receptor signaling pathway 104

Pathway sgRNA质粒文库交付内容

1、混合池(成品,也可定制化)

文库所有基因的sgRNA于1管中混合,可直接用于转染或慢病毒包装(图1)。

图1

交付内容:

  • • 200µg液态质粒
  • • CoA文件

2、阵列形式(定制化)

以一孔对应一靶标基因的阵列板形式提供,实现对靶标基因的灵活运用(图2)。

图2

交付内容:

  • • 阵列板式液态质粒
  • • 基因阵列排布信息
  • • CoA文件

参考资料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gonçalves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.

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